Uprawa tytoniu może być porażona przez węgorka chryzantemowca (Aphelenchoides ritzemabosi). Nicienie atakują początkowo liście dolne, a potem stopniowo coraz wyższe. Na porażonych liściach pojawiają się przebarwienia ograniczone nerwami liści, potem liście stopniowo zasychają.
![Tytoń_1 (1)](https://nefscience.pl/wp-content/uploads/2021/04/Tyton_1-1-768x693.jpg)
![Tytoń_2 (1)](https://nefscience.pl/wp-content/uploads/2021/04/Tyton_2-1-768x1082.jpg)
Tytoń może być uszkadzany przez niszczyka zjadliwego (D.dipsaci). Porażone rośliny są mniejsze od roślin zdrowych. Od podstawy łodygi pojawiają się pęcherzykowate zgrubienia, wewnątrz których tkanka jest luźna i włóknista. Liście są mniejsze, węższe. Od dołu liście zasychają. Silnie porażone rośliny zagniwają u podstawy i wywracają się. Występowaniu większych szkód sprzyja chłodne i wilgotne lato.
Korzenie tytoniu chętnie zasiedlają guzaki (Meloidogyne spp.). W Polsce jest to głównie guzak północny (M. hapla), ale roślina ta jest żywicielem większości gatunków guzaków żerujących na roślinach dwuliściennych. Objawem obecności guzaków są wyrośla na korzeniach i słabszy wzrost roślin
![guzak_tytoń guzak_tytoń](https://nefscience.pl/wp-content/uploads/2021/04/Tyton_3-768x576.jpg)
System korzeniowy tytoniu chętnie uszkadzają także korzeniaki (Pratylenchus spp.), w tym korzeniak szkodliwy (Pratylenchus penetrans) czy korzeniak pospolity (P. neglectus), ale także gatunki związane z klimatem łagodniejszym, jak P. brachyurus czy P. zeae. Nicienie tego rodzaju powodują uszkodzenia i zamieranie korzeni, redukcję systemu korzeniowego, co wpływa na słabszy wzrost roślin.
Korzenie tytoniu chętnie zasiedla także związany z m.in. tym gatunkiem mątwik tytoniowy (Globodera tabacum). Mątwik ten występuje na wielu kontynentach, także Europie - ale jak dotąd podawany z jej cieplejszych rejonów.