Uprawa słonecznika może być porażona przez węgorka chryzantemowca (Aphelenchoides ritzemabosi). Nicienie atakują początkowo liście dolne, a potem stopniowo coraz wyższe. Na porażonych liściach pojawiają się przebarwienia ograniczone nerwami liści, potem liście stopniowo zasychają.

Słoneczniki mogą być uszkadzane przez niszczyki (Ditylenchus spp.), zarówno niszczyka zjadliwego (D.dipsaci), jak i niszczka ziemniaczaka (D. destructor). Porażone rośliny wolniej się rozwijają i są niższe. Mogą także słabiej kwitnąć.

Korzenie słonecznika chętnie zasiedlają guzaki (Meloidogyne spp.), w Polsce guzak północny (M. hapla), ale roślina ta jest żywicielem większości  gatunków guzaków żerujących na roślinach dwuliściennych. Na korzeniach widoczne są zgrubienia, wyrośla w których żerują samice, ogładzając rośliny z substancji pokarmowych.

System korzeniowy słonecznika może także uszkadzać korzeniak szkodliwy (Pratylenchus penetrans). Porażone rośliny są mniejsze, często na polu można obserwować place słabiej rozwijających się roślin. Takie objawy często mylone są z innymi czynnikami, a tylko analiza roślin i gleby pozwala określić właściwego sprawcę obserwowanych uszkodzeń.